粤方联检大楼及配备设施建筑用地面积40195平方米（含澳方辖区内鸭涌河水域面积），主要位于珠海城轨站南侧国防路以东的鸭涌河地段，建筑主体架设在河道之上，将与澳方联检大楼进行无缝对接，以实现珠澳口岸“两地一检”的通关模式。粤方联检大楼分为A、B、C三个区，A区为通关及办公楼层，框架结构，建筑尺寸为36.2m×13.95m×26m，地上4层，层高6米；B区是通关及办公楼层，框剪结构，建筑尺寸为52.5m×36.7m×92m，地上11层，层高4.5米；C区是通关层，框架结构，建筑尺寸为108m×40m×22m，地上3层，层高6米。
